关键词：遗传性癌症；基因致病变异
重要性：关于与遗传性癌症综合征相关的疾病谱的知识可以改善患者的疾病诊断和管理，并有助于识别高危个体。
目的：通过全表型关联研究确定与遗传性癌症基因相关的表型。
设计、环境和参与者：这项全表型关联研究使用了来自3个队列参与者的健康数据。电子病历和基因组测序（eMERGEseq）数据集从年7月16日至年2月18日从10个美国医疗中心招募了主要健康的个体，通过电子健康记录（EHRs）进行的平均随访人数为12.7（7.4）年。
英国生物银行（UKB）队列从年3月15日到年8月1日招募了参与者，平均（SD）随访时间为12.4（1.0）年。
遗传性癌症登记处（HCR）从年5月1日到年12月31日在范德比尔特大学医学中心招募接受临床基因检测的患者，通过EHR的平均（SD）随访时间为8.8（6.5）年。
暴露：23个遗传性癌症基因中的生殖系变异。汇总每个基因的致病性和可能的致病性变异以进行关联分析。
主要结果和测量：eMERGEseq和HCR队列中的表型来自关联的EHRs。UKB中的表型来自多个健康相关数据来源。
结果：共确定了,名参与者，包括eMERGEseq队列中的23,名（平均[SD]年龄，47.8[23.7]岁；12,名女性[53.6%]），UKB队列中的,名（平均[SD]年龄，56.7[8.1]岁；,[55.6%]名女性）和HCR队列中的名（平均[SD]年龄，52.5[15.5]岁；[87.9%]名女性）。
复制了所有38个已建立的基因-癌症关联，并确定了19个新关联。
这些包括以下7种与肿瘤的关联：CHEK2与白血病（优势比[OR]=3.81；95%CI：2.64-5.48）和浆细胞肿瘤（OR=3.12；95%CI：1.84-5.28）；ATM与胃癌（OR=4.27；95%CI：2.35-7.44）和胰腺癌（OR=4.44；95%CI：2.66-7.40）；MUTYH（双等位基因）与肾癌（OR=32.2；95%CI：6.40-.73）；MSH6与膀胱癌（OR=5.63；95%CI：2.75-11.49）；APC与良性肝/肝内胆管肿瘤（OR=52.01；95%CI：14.29-.29）。
其余12项与非肿瘤性疾病的关联包括BRCA1/2与卵巢囊肿（OR=3.15；95%CI：2.22-4.4和OR=3.12；95%CI：2.36-4.12）；MEN1与急性胰腺炎（OR=33.45；95%CI：9.25-.02）；APC与胃炎和十二指肠炎（OR=4.6；95%CI：2.61-8.33）和PTEN与慢性胃炎（OR=15.68；95%CI：6.01-40.92）。
结论和相关性：这项遗传关联研究分析了3个大型队列的EHRs的结果表明，这些与遗传性癌症基因相关的新表型可能有助于癌症的早期发现和更好的管理。这项研究强调了在基因组医学中使用EHRs数据的潜在好处。
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策划：GoEun，梅浙
投稿及合作：yinqihang
dxy.cn题图来源：站酷海洛PLUS
ZengCJ,BastaracheLA,TaoR,etal.AssociationofPathogenicVariantsinHereditaryCancerGenesWithMultipleDiseases.JAMAOncol.Apr21.doi:10./jamaoncol...
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