DSP空间转录组+单细胞核测序
揭示新辅助疗法后胰腺癌样本中多重区域功能的变化
胰腺导管腺癌(PDAC)作为最为常见的胰腺癌病理亚型,近年来发病率逐步上升,预计到年,会成为美国癌症相关死亡的第二大原因。胰腺导管癌预后很差,目前临床治疗采用了越来越多的新辅助疗法,在很大程度上解决了肿瘤细胞微转移的风险,也很好的规避了术后放化疗耐药的出现。因此,深入了解新辅助疗法对术后肿瘤细胞的影响,可以充分认识目前治疗方法的不足,进一步优化新辅助疗法联合治疗方案。
目前用于胰腺癌临床样本的分析技术有诸多限制,而且都不能深入从微环境角度上对PDAC进行多维度分析。非因生物的DSP数字空间组学技术联合单细胞核测序技术,很好的解决了肿瘤微环境研究的痛点和难点。DSP技术是针对肿瘤免疫和肿瘤微环境高精度、多维度分析的新一代空间组学技术,可以在单张切片上通过形态学指导选择兴趣点(RegionofInterest,ROI),来实现基于每个ROI微环境的多达90种蛋白或>1,重癌症转录组的原位表达谱分析,其定量效果、通量和可靠性远超传统的以荧光信号为基础的多重免疫组化与多重免疫荧光技术。
年8月生物信息学专家AvivRegov的研究团队利用DSP空间组学技术与单细胞核测序(snRNA-seq)数据相结合,深入的阐明了免疫调节策略和治疗方案的选择,并在《BioRxiv》预印版上在线发表题为“Single-nucleusandspatialtranscriptomicsofarchivalpancreaticcancerrevealsmulti-