目前的诊断方法并不总是可靠地区分胰腺慢性炎症和胰腺癌。大约三分之一的诊断是不确定的。因此,来自德国癌症研究(DKFZ)医院(UKHD)的科学家寻找可以指定这种诊断的分子标记。
在机器学习的支持下,他们能够识别出DNA甲基化模式,从而可以高精度地区分慢性发炎和恶性改变的组织样本。初步初步结果表明,可以对血液样本进行诊断。
胰腺癌或简称PDAC(“胰腺导管腺癌”)预后极差。其原因是其通常在晚期发现较晚,误诊以及对现有疗法的明显耐药性。
影像学检查技术通常用于诊断。但这些缺点是它们不能总是可靠地区分胰腺癌和慢性胰腺炎症。慢性炎症被认为是胰腺癌的重要危险因素。大约6%至9%患有胰腺慢性炎症的患者后来发展为胰腺癌。但影像学检查甚至超声引导的细针活检也经常提供错误的诊断。
“这对患者来说是戏剧性的:如果恶性肿瘤被误诊为慢性炎症,他们就会失去治疗疾病的宝贵时间。然而,如果医生错误地认为炎症是癌,患者必须不必要地接受严重的手术干预,“德国癌症研究中心的J?rgHoheisel说。
为了改善这种情况并找到分子标记以达到更精确的鉴别诊断,Hoheisel现在与海德堡外科大学诊所的医生合作,对胰腺组织样本进行了大规模研究。该团队分析了个组织样本(PDAC,慢性发炎和健康),然后在一组独立的48个额外样本上验证了结果。在此之前,所使用的材料已由经验丰富的病理学家进行了两次独立评估。
该分析包括DNA甲基化的全基因组变异以及mRNA和microRNA数量。为了从丰富的数据中过滤掉恶性肿瘤和慢性炎症之间的相关差异,研究人员使用了机器学习方法。其他常用方法没有产生有用的结果。事实证明,DNA甲基化的差异允许比mRNA或microRNA数据少得多的生物标志物获得更高的准确性。
PRKCB基因中六个甲基化位置的签名提供了最明显的区分。这允许正确识别炎症和恶性组织。
对于临床使用,如果可以在血液而不是组织样本上进行分析,那将更有利。这种血液分析可以检测血液中循环的少量DNA,也被称为“液体活检”。
因此,海德堡团队还将六种甲基化标志物应用于慢性胰腺炎或胰腺癌患者的少量血液样本,以证明它们在血液中的适用性。与以前在组织中一样,甲基化标志物能够高精度地诊断患者。
“当然,该程序必须在大量血液样本上进行验证,并在临床条件下的试验中得到确认,以便最终评估其对临床实践的实际益处,”该出版物的资深作者J?rgHoheisel说。“如果结果在这个过程中得到证实,可能会对临床护理和患者预后产生重大影响。
Hoheisel认为,为这种数据分析开发的算法也有助于寻找其他疾病的生物标志物。
该论文发表在《Gut》杂志上。
更多信息:YenanWu等人,DNA甲基化特征准确区分组织和血浆中的胰腺癌和慢性胰腺炎,Gut()。DOI:10./gutjnl--