当当当当!
今天想给大家推荐的是一篇关于单细胞测序的文章,题目是利用单细胞RNA-seq揭示胰腺导管腺癌恶化过程中肿瘤微环境的动态变化。(小声bibi:私以为这是一篇非常适合刚入门单细胞测序的小白阅读的文献)。
1.背景BACKGROUND
胰腺导管腺癌(PDAC)是所有胃肠道肿瘤中最具侵袭性的。PDAC复杂的肿瘤内部异质性和特殊的肿瘤微环境为制定有效的治疗方案策略带来了巨大的挑战。因此,作者的目的是希望能通过单细胞RNA-seq来探索PDAC恶化过程中肿瘤微环境的动态变化。
2.方法METHODS
作者准备了共计11个样本(4个PDACI,4个PDACII,3个PDACIII),从这些样本中分离出单细胞后(总计个细胞)再经过10X单细胞RNA-seq技术得到原始数据,再经过QC,标准化,降维后获得高质量数据,最后再联合一系列生信分析进行数据挖掘。
当然细胞种类有不少,但是作者的重点