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苯并咪唑类衍生物作为IDO1抑制剂的研究 [复制链接]

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前言色氨酸是细胞生长代谢的必需氨基酸,体内大于95%的色氨酸沿着犬尿氨酸途径(KP)被氧化代谢,生成犬尿氨酸及其衍生物,催化这一过程的限速酶为IDO家族的三大成员:IDO1、IDO2、TDO。目前,研究最多、针对性最强的当属IDO1,它是一种含铁血红素单体蛋白,在肝脏外各组织中均有分布,正常生理条件下在机体中低表达,而在多种肿瘤细胞中高表达。已有研究表明IDO1能够介导肿瘤免疫逃逸,与肿瘤的恶性转化以及病人预后差等密切相关,被视为最具治疗潜力的抗肿瘤靶点之一。IDO1介导肿瘤免疫逃逸具体机制如下图所示,一方面,IDO1诱导色氨酸耗竭、GCN2活化和mTOR抑制,进而导致效应T细胞丧失活力;另一方面,IDO还导致犬尿氨酸及其下游代谢产物的积累,从而激活芳烃受体,促进调节性T细胞分化。目前已有多种IDO1抑制剂被报道,但迄今为止该靶点仍无上市药物,发现有效的和临床上有用的IDO1抑制剂是一个巨大的挑战。年IDO抑制剂Epacadostat与Keytruda(PD-1抑制剂帕博利珠单抗)联用的关键三期临床ECHO-失败,引起业界震动,但这并不能浇灭大家对于IDO1研究的热情,继续探究不同结构化合物以及优化临床试验设计来突破这一瓶颈。临床IDO抑制剂的化学结构如下图:大多数IDO1抑制剂的具有共同的结合模式。①双环片段填充口袋A;②带有电子对的原子(如S、O、N)与血红素铁结合;③大配体中的基团能够与口袋B形成起范德华作用力;④与IDO上特定结构建立起氢键的片段等。早在年,AlbertoMassarotti课题组发现了一类咪唑类化合物,其与IDO1活性位点具有独特的结合模式,侧链伸入一个额外口袋C,与Lys形成关键氢键相互作用。基于此,该课题组建立了下图所示的咪唑噻唑类骨架的药效团模型(Ar:芳香族,M:金属粘合剂,HBD:氢键供体,HBA:氢键受体)。该课题组最新的报道(J.Med.Chem.)将这一新信息整合并用于基于结构的虚拟筛选,发现了苗头化合物10。与之前报道的IDO抑制剂相比,化合物10具有新颖的苯并咪唑结构,且在蛋白质活性部位具有更广泛的结合,包括与pocketC的相互作用。化合物10对于A细胞的IC50为16nM,且对正常细胞有较好的选择性。体外配体结合实验中,IDO的Kd值为0.55±0.36μM,而阳性对照epacadostat的Kd值为3.46±0.86μM),证实化合物10确实与IDO1结合,是一种直接的靶点结合。化合物10的结构及其可能的相互作用如下图所示。本文基于化合物10可能的结合模式,进行了构效关系的研究。通过结构优化获得具有显著抗肿瘤细胞活性的化合物23和35,IC50值为72nM和90nM,后续选择这三个化合物(10、23、35)进行生物学研究。相比于TDO,该3个化合物对IDO1都有比较好的选择性,对于多种肿瘤细胞都有较好的抑制效果。同时证实了IDO抑制剂会降低胰腺导管腺癌(PDAC)患者单核细胞限制T细胞增殖的能力。化合物23具有略高的体外代谢稳定性,进而考查了其体内PK/PD性质。总结本文通过基于结构的虚拟筛选,发现了一类苯并咪唑类IDO1抑制剂,与已知的IDO1抑制剂相比,它在化学结构、活性部位的位置、合成的可行性和对TDO的特异性等方面具有独特的特征。实验表明,该类化合物可能为提高IDO1靶向免疫治疗的有效性奠定基础。只是目前化合物的体内半衰期较短,期待后期的优化推进结果。参考文献[1]SerafiniM.DiscoveryofHighlyPotentBenzimidazoleDerivativesasIndoleamine2,3-Dioxygenase-1(IDO1)Inhibitors:FromStructure-BasedVirtualScreeningtoinVivoPharmacodynamicActivity.JMedChem.;63(6):.[2]GriglioA.Amulti
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